根據(jù)一篇總結(jié)了關(guān)于綠色植物基因組的已知信息以及植物學(xué)家如何提高賭注的評(píng)論論文，科學(xué)家們知道的植物的完整基因組序列遠(yuǎn)少于其他生命形式 。

這篇論文出現(xiàn)在美國國家科學(xué)院院刊的特刊中，該 論文是地球生物基因組計(jì)劃 (EBP) 的進(jìn)展報(bào)告，這是一個(gè)旨在最終“對(duì)所有生命的 DNA 進(jìn)行測序”的國際聯(lián)盟。著名植物分類學(xué)家 John Kress 是 EBP 的聯(lián)合主席，也是該評(píng)論論文的資深作者，目前是達(dá)特茅斯學(xué)院的訪問學(xué)者。

“地球生物基因組計(jì)劃實(shí)際上是跨領(lǐng)域?qū)ιM(jìn)行采樣，無論是動(dòng)物、真菌還是植物，”克雷斯說?？茖W(xué)家們希望在短短 10 年內(nèi)對(duì)驚人的 180 萬個(gè)已知物種的代表性個(gè)體的基因組進(jìn)行測序。該項(xiàng)目于三年前啟動(dòng)，不僅將匯集現(xiàn)有的全球基因組測序工作，還將建立快速樣本收集、標(biāo)準(zhǔn)化 DNA 測序和公平共享數(shù)據(jù)的手段。

“我們的想法是在 10 年內(nèi)為每個(gè)物種生成完整的參考基因組，”克雷斯說。參考基因組是 DNA 藍(lán)圖，可作為物種個(gè)體基因的代表性示例。

克雷斯說，有了這樣一個(gè)針對(duì)每個(gè)物種的藍(lán)圖，研究人員就可以開始回答一些主要的科學(xué)問題，例如進(jìn)化是如何運(yùn)作的，或者物種如何在群落中相互作用。

科學(xué)、健康和商業(yè)也有無數(shù)潛在的好處。“無論您是科學(xué)家，還是從事農(nóng)業(yè)、林業(yè)、漁業(yè)或保護(hù)工作，擁有基因組信息現(xiàn)在都是非常基本且必不可少的步驟，”Kress 解釋說。

植物基因組提出了一個(gè)特殊的挑戰(zhàn)?？死姿拐f，它們往往比動(dòng)物基因組更大、更復(fù)雜。據(jù)估計(jì)，綠色植物有近 50 萬種，但已知的完整基因組序列不到 1000 種。

在他們的論文中，克雷斯和他的合著者總結(jié)了關(guān)于植物基因組的已知信息，確定了重大問題，并制定了生成基因組的各種路線圖。標(biāo)準(zhǔn)化——確保 DNA 數(shù)據(jù)的生成和存儲(chǔ)方式使得不同實(shí)驗(yàn)室可以輕松比較它們——是關(guān)鍵步驟。

克雷斯希望沿途的技術(shù)改進(jìn)將有助于使項(xiàng)目保持在正軌上。人類基因組計(jì)劃花費(fèi)了 10 多年的時(shí)間來對(duì)一個(gè)基因組進(jìn)行測序，但現(xiàn)在，他說，“我們可以在一周內(nèi)完成。”