紐約州紐約市(2021 年 11 月 17 日)—西奈山研究人員開發(fā)了一種新模型,該模型使用來自數(shù)百名患者的 DNA 和 RNA 測序數(shù)據(jù)來識(shí)別特定基因和基因改變,這些基因和基因改變導(dǎo)致了一種從未定義的血癌亞型,稱為多發(fā)性骨髓瘤。他們還根據(jù)研究結(jié)果確定了潛在的靶向治療,如11 月《科學(xué)進(jìn)展》報(bào)道的那樣。
這是第一項(xiàng)使用多組學(xué)、多種數(shù)據(jù)類型的集成和分析來創(chuàng)建多發(fā)性骨髓瘤計(jì)算模型的研究,科學(xué)家將其命名為多發(fā)性骨髓瘤患者相似性網(wǎng)絡(luò) (MM-PSN)。分析中確定的基因包括一些與高復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)的基因。
主要作者亞歷山德羅·拉加納博士說:“我們的發(fā)現(xiàn)對(duì)新型精準(zhǔn)醫(yī)療工具和臨床試驗(yàn)的開發(fā)具有直接意義,因?yàn)椴煌幕颊邅喗M可能會(huì)根據(jù)其基因組和轉(zhuǎn)錄組譜對(duì)不同的靶向治療和免疫腫瘤學(xué)治療做出反應(yīng),”西奈山蒂施癌癥研究所腫瘤科學(xué)助理教授。“這些研究對(duì)于推進(jìn)我們對(duì)骨髓瘤病理學(xué)的理解至關(guān)重要,并為未來研究藥物再利用方法鋪平了道路,這些方法旨在針對(duì)特定患者亞群量身定制的新療法。”
研究人員認(rèn)為,MM-PSN 通過將具有高度相似的 DNA 和 RNA 譜的患者關(guān)聯(lián)起來,形成比以前的分類更細(xì)粒度和同質(zhì)的類別,從而捕捉到多發(fā)性骨髓瘤的復(fù)雜性。在 MM-PSN 模型中,研究人員將患者表示為節(jié)點(diǎn),就像在社交網(wǎng)絡(luò)中一樣,根據(jù)他們的 DNA 和 RNA 譜的相似程度相互連接。
為了創(chuàng)建 MM-PSN,研究人員分析了從 655 名新診斷的多發(fā)性骨髓瘤患者的 DNA 和 RNA 測序中獲得的五種不同類型的數(shù)據(jù)。MM-PSN 的分析確定了三個(gè)主要組和 12 個(gè)亞組,這些亞組富含不同的遺傳和分子特征,揭示了先前定義的疾病亞型(例如超二倍體和 MMSET 易位,它們是染色體異常)的顯著多樣性,以及對(duì)疾病發(fā)生的新見解每個(gè)患者癌癥中的主要和次要基因組改變。
MM-PSN 的最大發(fā)現(xiàn)之一是 1 號(hào)染色體區(qū)域內(nèi)的異常,這是與高復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)的最重要的單一遺傳變異;該研究表明,現(xiàn)在應(yīng)該將其納入國際骨髓瘤分期系統(tǒng)。研究人員還確定了多發(fā)性骨髓瘤當(dāng)前分類之外的新高風(fēng)險(xiǎn)患者類別,包括復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)最高和總生存期最短的患者之一,以及另一個(gè)通常與更有利的結(jié)果相關(guān)的患者。