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基因組研究揭示了遺傳性視網(wǎng)膜疾病的不同人群

摘要 由加州大學(xué)圣地亞哥分校的科學(xué)家和加州大學(xué)圣地亞哥分校健康中心 Shiley Eye Institute 的科學(xué)家領(lǐng)導(dǎo)的國(guó)際研究團(tuán)隊(duì)擴(kuò)大并加深了對(duì)遺傳

由加州大學(xué)圣地亞哥分校的科學(xué)家和加州大學(xué)圣地亞哥分校健康中心 Shiley Eye Institute 的科學(xué)家領(lǐng)導(dǎo)的國(guó)際研究團(tuán)隊(duì)擴(kuò)大并加深了對(duì)遺傳性視網(wǎng)膜營(yíng)養(yǎng)不良 (IRD) 如何影響不同人群的理解,并在此過(guò)程中,確定了可能導(dǎo)致這些疾病的新基因變異。

該研究結(jié)果發(fā)表在 2021 年 10 月 18 日的PLOS Genetics 上。

IRD 是一組疾病,從色素性視網(wǎng)膜炎到無(wú)脈絡(luò)膜血癥,會(huì)導(dǎo)致進(jìn)行性視力喪失,甚至失明。每個(gè) IRD 至少由一個(gè)基因突變引起,盡管同一基因的突變可能導(dǎo)致不同的 IRD 診斷。

IRD 很少見,但它們影響所有年齡段的人,以不同的速度發(fā)展,即使在患有相同疾病的家庭中也是如此。具體診斷取決于發(fā)現(xiàn)遺傳致病突變。

食品和藥物管理局已批準(zhǔn)基因療法來(lái)治療一種涉及 RPE65 基因的 IRD,但對(duì)于由 280 多個(gè)不同基因突變引起的其他 IRD,尚無(wú)治愈方法或治療方法被證明可以減緩疾病進(jìn)展。

研究人員對(duì)來(lái)自 108 個(gè)不相關(guān)家族譜系的 409 人進(jìn)行了全基因組序列 (WGS),每個(gè)人都有先前診斷出的 IRD。WGS 是確定個(gè)體 DNA 序列的全部或接近全部的過(guò)程。它提供了一個(gè)人的整個(gè)基因組的全面畫像,包括突變和變異,可用于廣泛的比較目的。

研究參與者來(lái)自三個(gè)不同的地理區(qū)域:墨西哥、巴基斯坦和居住在的歐洲裔人。從所有參與者的血液樣本中進(jìn)行基因組分析,揭示了 108 個(gè)譜系中 62 個(gè)譜系的致病變異。在 62 個(gè)家族中總共發(fā)現(xiàn)了 94 個(gè)基因變異:52 個(gè)變異以前被確定為致病基因,42 個(gè)沒有。令人驚訝的是,超過(guò)一半的新變體沒有被列入基因組聚合數(shù)據(jù)庫(kù),這是一個(gè)國(guó)際基因組數(shù)據(jù)匯編。

總體而言,在 63% 的墨西哥參與者、60% 的巴基斯坦參與者和 48% 的歐洲人中檢測(cè)到了致病變異。

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