SARS CoV-2表面上的棒狀刺突蛋白是COVID-19大流行病的矛尖。尖峰通過ACE2受體與人體細(xì)胞結(jié)合,然后急劇改變形狀,頂起刀形以將細(xì)胞膜與冠狀病毒的外膜融合在一起,并打開了感染冠狀病毒的大門。由波士頓兒童醫(yī)院領(lǐng)導(dǎo)的一項研究首次凍結(jié)了刺突蛋白的“前”和“后”形狀。
這項研究于7月21日在《科學(xué)》雜志上發(fā)表,它還捕獲了刺突蛋白的一些令人驚訝的特征,該突觸蛋白也是我們抗體靶向的主要蛋白,也是目前人類測試中用于大多數(shù)疫苗的蛋白。由陳冰博士領(lǐng)導(dǎo)的研究人員認(rèn)為,這些意外的功能可能有助于SARS-CoV-2躲避免疫系統(tǒng)并在環(huán)境中生存更長的時間。它們也可能對疫苗和治療發(fā)展產(chǎn)生影響。
使用低溫電子顯微鏡技術(shù),波士頓兒童分子醫(yī)學(xué)部的Chen和同事在病毒和細(xì)胞膜融合之前和之后建立了刺突蛋白的結(jié)構(gòu)。他們發(fā)現(xiàn),在“融合后”的狀態(tài)下,蛋白質(zhì)呈現(xiàn)出折疊成自身的剛性發(fā)夾狀。
有趣的是,他們還發(fā)現(xiàn)刺突蛋白有時會過早地從其原始的“前”形變?yōu)?ldquo;后”形,而病毒不會與ACE2受體結(jié)合。
“我們建議構(gòu)象改變有兩條途徑,” Chen說。“一個是ACE2依賴性的,它允許病毒進入宿主細(xì)胞。第二個是ACE2依賴性的。”
冠狀病毒的防御機制?
由于自發(fā)形狀的改變,冠狀病毒顆粒經(jīng)常帶有兩種形式的刺突蛋白,而剛性的“后”形則從病毒表面突出更多。Chen建議即使在不與細(xì)胞結(jié)合的情況下也能夠呈現(xiàn)這種替代形狀,可能有助于使SARS-CoV-2在環(huán)境中保持活力,從而防止SARS-CoV-2降落在表面上時分解。這可以解釋為什么病毒似乎可以在各種表面上存活數(shù)小時至數(shù)天。
Chen說:“大多數(shù)病毒不能在宿主體內(nèi)存活很長時間。”“我們認(rèn)為這些融合后尖峰的剛性結(jié)構(gòu)可以保護病毒。”
逃避免疫檢測
研究人員推測,有些峰值假定融合后形式過早也可能會保護SARS-CoV-2免受我們的免疫系統(tǒng)的影響,誘導(dǎo)出非中和且無法有效遏制該病毒的抗體。實際上,融合后的峰值可能充當(dāng)誘騙免疫系統(tǒng)的誘餌。
該團隊還驚訝地發(fā)現(xiàn),與融合前的峰值相似,融合后的峰值在其表面上均勻分布的位置具有聚糖或糖分子。聚糖是幫助病毒避免免疫檢測的另一個功能。
陳認(rèn)為,他的團隊的發(fā)現(xiàn)對疫苗開發(fā)具有重要意義。他指出,目前使用刺突蛋白刺激免疫系統(tǒng)的疫苗制劑可能具有融合前和融合后形式的不同混合,這可能會限制其保護功效。
他說:“我們需要考慮如何穩(wěn)定刺突蛋白。”“如果蛋白質(zhì)不穩(wěn)定,則可以誘導(dǎo)抗體,但在阻斷病毒方面效果較差。批次之間可能會有變異。”
利用艾滋病毒的經(jīng)驗
Chen多年來對HIV的研究幫助他的團隊在研究SARS-CoV-2方面一臂之力。兩種病毒都被稱為包膜病毒,需要將其膜與它們試圖進入的細(xì)胞融合。兩者都使用相同的千斤頂?shù)缎螤钭兓?,并且都在其表面上帶有糖裝飾的刺突蛋白。最后,開發(fā)中和抗體的挑戰(zhàn)困擾著HIV疫苗的開發(fā),它也分散了免疫系統(tǒng)的注意力,產(chǎn)生了無法關(guān)閉病毒的多種抗體。
Chen說:“我認(rèn)為SARS-CoV-2可能比HIV更容易被感染,但是我們必須要看到。”“如果第一輪疫苗在3期試驗中效果不佳,那么這種對突波結(jié)構(gòu)的新認(rèn)識將有助于我們設(shè)計更強大的疫苗。”