來自土壤中常見細(xì)菌菌株的單一蛋白質(zhì)將為科學(xué)家提供一種更精確的RNA編輯方法。

康奈爾大學(xué)，洛克菲勒大學(xué)和紀(jì)念斯隆·凱特琳癌癥中心的最新研究發(fā)表在7月3日的《科學(xué)》雜志上，該蛋白質(zhì)稱為AcrVIA1，可以終止CRISPR-Cas13編輯過程。

共同作者馬丁·維德曼(Martin Wiedmann)博士說：“我們正在擴(kuò)展科學(xué)工具箱，以有效使用CRISPR而不會(huì)引起副作用。”'97年，蓋勒特(Gellert)家庭食品安全教授，康奈爾大學(xué)(Cornell)食品安全實(shí)驗(yàn)室和牛奶質(zhì)量改善計(jì)劃主任。“由于這種細(xì)菌，我們有機(jī)會(huì)關(guān)閉并增強(qiáng)對(duì)RNA進(jìn)行改變的能力。”

CRISPR，或成簇的規(guī)則間隔的短回文重復(fù)序列，是一種實(shí)驗(yàn)室機(jī)制，可以像顯微剪刀一樣起作用，并精確地編輯DNA中包含的基因。在當(dāng)今使用的六種類型的CRISPR中，CRISPR-Cas13可以編輯RNA，迄今為止，RNA在編輯過程中缺乏制止作用。

科學(xué)家們說，由于導(dǎo)致COVID-19病的冠狀病毒SARS-CoV-2是一種RNA病毒，因此這種新的編輯附件可能對(duì)冠狀病毒研究人員有用。

主要作者Alex Meeske是洛克菲勒大學(xué)教授，高級(jí)作者Luciano Marraffini實(shí)驗(yàn)室的博士后研究人員，他懷疑李斯特菌中的蛋白質(zhì)(噬菌體)可能對(duì)RNA編輯有用。

在研究開始之初，Meeske與食品安全專家Wiedmann取得了聯(lián)系，以從他的食物病原體收集物中獲取遺傳細(xì)菌樣本。魏德曼實(shí)驗(yàn)室的博士生廖景秋將研究范圍從大約1,500個(gè)細(xì)菌候選者縮小到62個(gè)菌株。

Wiedmann實(shí)驗(yàn)室將這些樣品轉(zhuǎn)移到了洛克菲勒，在那里實(shí)習(xí)生愛麗絲·卡塞爾(Alice Cassel)對(duì)62個(gè)菌株進(jìn)行了測(cè)序，并分離了20種候選蛋白質(zhì)。

一種菌株脫穎而出：李斯特菌Seeligeri，一種在土壤中到處可見的無害細(xì)菌。不像它的強(qiáng)大表親(食源性單核細(xì)胞增生李斯特菌)，它不會(huì)引起人類疾病。

洛克菲勒大學(xué)的科學(xué)家發(fā)現(xiàn)，源自L. seeligeri的蛋白AcrVIA1立即停止了CRISPR編輯過程。Meeske說：“ AcrVIA1在控制Cas13的應(yīng)用中非常有用。任何Cas13編輯的東西，這種抗CRISPR蛋白都可以關(guān)閉。”“這是您可以在CRISPR編輯過程中使用的'kill switch'，它已成為我們可使用的其他工具。”

維德曼解釋說，科學(xué)家現(xiàn)在可以用更嚴(yán)格的手段研究RNA問題。他說：“這種工具使我們更加精確。”