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DNA存儲信息的能力得到提升

一個跨學(xué)科研究人員小組發(fā)現(xiàn)了一種新技術(shù),可以以前所未有的準(zhǔn)確性和效率在DNA信息中存儲這種情況,在本例中為“綠野仙蹤”,譯為世界語。該技術(shù)利用DNA交鏈的信息存儲能力,以持久且緊湊的方式編碼和檢索信息。

該技術(shù)在本周《美國科學(xué)院院刊》上的一篇論文中進(jìn)行了描述。

這項研究的作者之一,分子生物學(xué)副教授伊利亞·芬克爾斯坦(Ilya Finkelstein)表示:“關(guān)鍵的突破是一種編碼算法,即使在存儲過程中DNA鏈部分受損時,也可以準(zhǔn)確地檢索信息。”

人類正在以比過去高得多的速度創(chuàng)建信息,這促使人們需要一種有效地存儲更多信息并且持續(xù)時間長的方式。諸如Google和Microsoft之類的公司正在探索使用DNA存儲信息的公司。

與Finkelstein合作進(jìn)行這項研究的研究科學(xué)家斯蒂芬·瓊斯(Stephen Jones)說:“我們需要一種存儲這些數(shù)據(jù)的方法,以便可以隨時隨地以可讀的格式獲得這些數(shù)據(jù)。”Bill Press,計算機(jī)科學(xué)與整合生物學(xué)聯(lián)合任命的教授;和博士學(xué)位校友約翰·霍金斯(John Hawkins)。“這個想法利用了數(shù)十億年來生物學(xué)的優(yōu)勢:將大量信息存儲在一個很小的空間中,可以持續(xù)很長時間。DNA不會占用太多空間,可以在室溫下存儲它,可以持續(xù)數(shù)十萬年。”

DNA的效率是當(dāng)前存儲方法的500萬倍。換句話說,一滴DNA可以存儲與兩個裝有數(shù)據(jù)服務(wù)器的沃爾瑪相同數(shù)量的信息。而且,DNA不需要永久性的冷卻和容易發(fā)生機(jī)械故障的硬盤。

只有一個問題:DNA容易出錯。當(dāng)遺傳密碼有錯誤時,它與計算機(jī)密碼有錯誤時有很大不同。計算機(jī)代碼中的錯誤往往顯示為代碼中的空白點。DNA序列中的錯誤顯示為插入或缺失。問題在于,當(dāng)DNA中刪除或添加某些東西時,整個序列會移動,而沒有空白點可以提醒任何人。

以前,當(dāng)信息存儲在DNA中時,需要保存的信息片段(例如小說中的一段)將重復(fù)10到15次。讀取信息后,將對重復(fù)進(jìn)行比較以消除任何插入或刪除。

瓊斯說:“我們找到了一種更像網(wǎng)格的方式來構(gòu)建信息的方法。”“每條信息都會增強(qiáng)其他信息。這樣一來,它只需讀取一次即可。”

研究人員開發(fā)的語言還避免了容易出錯或難以閱讀的DNA部分。語言的參數(shù)也可以隨所存儲信息的類型而變化。例如,在一本小說中丟掉單詞并不像在納稅申報表中丟掉零一樣大。

為了演示如何從降解的DNA中檢索信息,研究小組將其“綠野仙蹤”代碼置于高溫和極端潮濕的環(huán)境中。即使這些惡劣條件損壞了DNA鏈,所有信息仍然可以成功解碼。

霍金斯說:“我們試圖同時解決該過程中的所有問題,”霍金斯最近在UT的奧登大學(xué)計算工程與科學(xué)學(xué)院任職。“最終我們?nèi)〉昧朔欠驳某删汀?rdquo;

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