在許多生物中，RNA介導(dǎo)的染色質(zhì)調(diào)節(jié)是基因表達(dá)的核心，但迄今為止，人們對(duì)RNA調(diào)節(jié)DNA染色質(zhì)包裝并由此打開和關(guān)閉基因的機(jī)制的了解仍然很少。

但是，Caroline Dean教授實(shí)驗(yàn)室的方曉峰博士的新論文已經(jīng)能夠證明形成染色質(zhì)的蛋白質(zhì)與RNA處理機(jī)制之間的物理相互作用。這確定了反義RNA的加工如何影響染色質(zhì)狀態(tài)并定量調(diào)節(jié)擬南芥FLC基因座的表達(dá)。

該小組使用了一種稱為交聯(lián)核免疫沉淀和質(zhì)譜分析(CLNIP-MS)的方法，該方法先前是由該小組與約翰·英內(nèi)斯中心蛋白質(zhì)組學(xué)小組的蛋白質(zhì)專家共同開發(fā)的，該方法使用甲醛捕獲植物中蛋白質(zhì)的相互作用，否則會(huì)太短暫而無法學(xué)習(xí)。

在論文中，研究人員詳細(xì)介紹了反義RNA COOLAIR如何與進(jìn)行RNA加工的3'RNA加工因子結(jié)合。研究小組隨后證明了這些3'RNA加工因子與改變?nèi)旧|(zhì)結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)動(dòng)態(tài)結(jié)合，稱為FLD / LD / SD626，并且這種復(fù)合物共同阻礙了基因被開啟的能力。

主要作者馮曉峰博士解釋道;“這項(xiàng)工作是全面了解RNA介導(dǎo)的染色質(zhì)沉默的重要一步。我們已經(jīng)能夠?qū)NA加工因子與染色質(zhì)修飾劑進(jìn)行機(jī)械連接。”

這些新近定義的物理聯(lián)系導(dǎo)致染色質(zhì)變化，從而關(guān)閉了FLC(調(diào)控開花的關(guān)鍵基因)。如果去除了3'加工因子或染色質(zhì)修飾劑，則基因被打開。

有趣的是，盡管酵母中確切的等效機(jī)制仍然未知，但該過程顯示出與酵母中的基因調(diào)控相似。表觀遺傳機(jī)制的保守性意味著這項(xiàng)工作與理解基因在所有生物體中如何開啟和關(guān)閉有關(guān)。