可憐的豬。我們將其歸咎于它在2012年給我們帶來了豬流感，一種豬冠狀病毒，以及在某些古老的棚屋中造成沙門氏菌的沙門氏菌，沙門氏菌會引起腸道不適和傷寒。但是，現(xiàn)在看來，幾千年前，人類首先獲得了沙門氏菌，并且可能已經(jīng)將其傳給了豬。

一項新的研究表明，歐亞大陸的早期農(nóng)民從狩獵和采集的游牧方式轉(zhuǎn)為耕作時，給自己帶來了一種更致命的沙門氏菌。通過與家畜及其廢物在近處安頓下來，他們給了沙門氏菌腸菌(Salmonella enterica)，它潛伏在一個未知的動物宿主中，可以很容易地接觸到適應人類的人類腸道。豬后來可能從人或另一只動物身上拾取了病原體。

長期以來，研究人員一直認為，從覓食向農(nóng)業(yè)的過渡使人類更加惡心。依靠一些農(nóng)作物和家畜，早期農(nóng)民的飲食和狩獵者采集的食物相比，飲食變化和健康程度更低。他們還靠近病原體持續(xù)存在的人類和動物糞便。但是很少有傳染性疾病在骨骼上留下痕跡，因此這些病原體很難在化石中發(fā)現(xiàn)。

在一項技術(shù)突破中，由人口遺傳學家Felix Key和Johannes Krause以及馬克斯·普朗克人類歷史科學研究所的細菌基因組學家Alexander Herbig領(lǐng)導的團隊開發(fā)了一種稱為HOPS的方法，用于檢測致病細菌中的古代DNA片段。Key，現(xiàn)任美國麻省理工學院的Herbig團隊使用此方法篩選了距歐洲，俄羅斯和土耳其6500多年歷史的2739名人類牙齒中的細菌DNA。從這些牙齒上，他們能夠重建八個腸炎鏈球菌基因組。

當研究人員將這些基因組分類到沙門氏菌的家譜中時，沙門氏菌有2500多個菌株，他們發(fā)現(xiàn)來自古代農(nóng)民和牧民的所有六個腸炎沙門氏菌基因組都歸為一組。但是來自俄羅斯6500年歷史的覓食者的兩個腸炎沙門氏菌基因組又落入其他群體，其中一個帶有導致馬和羊流產(chǎn)的毒株。生活在5500至1600年前的農(nóng)民中感染的菌株包括副傷寒C的祖先，該菌株引起致命的腸熱，類似于今天的傷寒。

研究人員不知道哪個動物宿主把它給人類最初，但它可能不是豬，它們攜帶著只有4000年前出現(xiàn)了一個密切相關(guān)的應變，根據(jù)該分子約會沙門氏菌家譜，如今研究人員報告在自然生態(tài)與進化。

古代副傷寒C的祖先菌株尚未專門適應人類：病原體感染了許多動物，并且缺乏引起傷寒樣發(fā)熱的基因。這表明人類最初患有一種較溫和的疾病，也感染了他們的牲畜。

亞利桑那州立大學坦佩分校的人類遺傳學家安妮·斯通(Anne Stone)希望，研究小組可以從覓食者身上提取更多的腸炎沙門氏菌樣本。但新研究揭示了細菌病原體如何轉(zhuǎn)移宿主，斯通說。她說，它還可以幫助研究人員更多地了解病原體何時何地從另一種物種跳入人類的原因，這是鑒于當前冠狀病毒爆發(fā)的及時教訓。